Закарпатська митниця, розташована на перетині кордонів з індустріально розвиненими регіонами Європи, по праву вважається «Західними воротами України». Її історія розпочалася 8 вересня 1945 року зі створення Чопської митниці. Вона займала особливе місце в митній системі, оскільки знаходилася на стику кордонів кількох держав — Угорщини, Румунії, Чехословаччини та Польщі.
У перші роки діяльності митниця складалася переважно з колишніх фронтовиків. У 1968 році відкрили митний пост «Тиса», а 1980 року він став цілодобовим міжнародним пунктом пропуску. Після проголошення незалежності України в 1991 році, митниці Закарпаття (Чопська, Ужгородська, Рахівська, Дяківська, Берегівська, Виноградівська) стали одними з базових у розбудові митної служби.
Зростання потоків вантажів і пасажирів призвело до розширення митних установ. У 1994 році всі митниці Закарпатської області увійшли до складу Карпатського територіального митного управління, а пізніше, після низки реорганізацій, митниця отримала свою сучасну назву.
Наразі у зоні діяльності Закарпатської митниці функціонує 20 пунктів пропуску, а в штаті працює понад 1100 фахівців. За 8 місяців 2025 року митниця перерахувала до державного бюджету 15,4 млрд грн. За цей же період було порушено 613 справ про митні правопорушення на суму понад 181 млн грн.
У боротьбі з контрабандою митникам допомагають 18 кінологічних команд. Завдяки чотирилапим помічникам лише цього року було виявлено значні партії наркотичних засобів. Крім того, з початку повномасштабного вторгнення Закарпатська митниця передала на потреби ЗСУ конфіскованих товарів на понад 121 млн грн.